La facciata, di sobria eleganza, fa angolo retto con l'adiacente chiesa di San Giovanni e Paolo. Il progetto dell'edificio si deve a Pietro Lombardo, anche se venne portato a termine da Mauro Condussi. Considerato un prezioso gioiello rinascimentale, l'edificio si erge su due piani con una splendida facciata ornata da leoni, finte prospettive nei 4 pannelli ai lati delle porte ed un portale riccamente decorato, opera di Bartolomeo Bon. Oggi l'intero edificio è di proprietà dell'ASL 12 Veneziana, l'ingresso al pian terreno funge anche da ingresso per l'Ospedale Civile. All'interno della scuola si trovano il Museo della Storia della Medicina e la Biblioteca medico-storica.