L'imponente facciata della chiesa domina sul ristretto spazio di campo San Zaccaria e sugli adiacenti edifici. Edificata presumibilmente nel IX secolo, per ospitare i resti di San Giovanni Battista, dono dell'imperatore bizantino, subì parecchie ricostruzioni riconoscibili anche dalla sovrapposizione di stili. Un primo importante rifacimento venne iniziato nel 1440 da Antonio Gambello, ma l'opera venne portata a termine solamente nel 1490 da Mario Condussi. E' al Condussi che si deve la facciata in marmo bianco d'Istria tripartita da colonne binate sulla quale si aprono numerose finestre e grande timpano ad arco sormontato dalla statua del Santo. L'interno a tre navate divise da alte colonne è comunque un armonioso intreccio di stili nel quale riconosciamo il gotico delle absidi e il rinascimentale nelle alte volte a crociera. La chiesa custodisce importanti opere tra le quali: la Vergine in trono con Bambino di Giovanni Bellini, la nascita del Battista di Tintoretto.