Il borgo grazie alle sue abbondanti sorgenti termali dispone di due centri termali: Le Terme San Giovanni e le terme Antica Quarciolaia. Posti in uno splendido scenario naturale, entrambi gli stabilimenti sono un ottimo punto di partenza per visitare il territorio circostante come le necropoli etrusche di Poggio Pinci e Castello di Poggio oppure il Borgo delle Serre.
Terme San Giovanni: le terme dispongono di un hotel a 4 stelle, di due ristoranti, di un'area cofee relax, di 2 ampie piscine esterne ed una interna, tutte dotate di aree idromassaggio, cascate cervicali, getti d'acqua, solarium, un'attrezzatissima area wellness.
Antica Querciolaia: il centro dispone di numerose piscine termali alcune esterne ed altre interne, le piscine hanno temperature che vanno dai 25 ai 39°C. Sono tutte dotate di area idromassaggio, getti d'acqua, cascate cervicali, percorsi vascolari e percorsi relax. Il centro dispone di un'ampia area wellness dotata di moderne attrezzature, di un area con dotazioni per cure termali più specialistiche unita ad un attrezzato centro di medicina specialistica.
Le acque minerali delle piscine San Giovanni Terme Rapolano sgorgano naturalmente dalla sorgente alla temperatura di 39 °C. Gli elementi naturali che le compongono sono principalmente zolfo e bicarbonato di calcio. Grazie agli elementi che la compongono le acque sono indicati per trattamenti della pelle, dell'apparato respiratorio e circolatorio.
Le terme sono convenzionate con il Servizio Sanitario Nazionale
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