Ha sede confinante con il perimetro del Bioparco. Fu fondato nel 1932 per ospitare le collezioni naturalistiche della Regia Università di Roma (l’attuale Università La Sapienza) e dell’Università Pontificia. Ospita più di quattro milioni di esemplari conservati che vanno da molluschi di piccole dimensioni ad una balenottera di 16 metri. Molti degli esemplari sono visionabili solo per obiettivi di ricerca. Le sale a tema e gli strumenti multimediali e multisensoriali consentono un approccio alla biodiversità e all’adattamento ai diversi tipi di ambiente.
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